申通快递遗失快递的赔偿时间主要涉及两个方面：
快递到达客户手中的时间
如果快递在一定时间内（一般为13天）没有到达客户手中，快递公司会把此件当做是丢失件处理。
资金赔付的时间
一般提交过寄件人的身份证信息以后，快递公司的员工会走申请流程，员工一般会把损失提前垫付给客户以减少不必要的麻烦。赔偿金额在1000元以内的，快递公司会主动联系寄件人并提供身份证信息申请赔付，然后重新免费帮客户发一份相同重量的快递。
综合以上信息，可以得出以下结论：
快递丢失后，快递公司一般会在13天内将快递视为丢失件并进行处理。
资金赔付的时间取决于快递公司的处理进度，一般需要几天时间，若赔偿不足或快递公司不赔偿，客户可以向人民法院起诉，可能需要几个月时间。
建议您在遇到快递丢失的情况时，及时联系快递公司并提供相关证据，以便尽快获得赔偿。
